Přednost při očkování mají lidé z tzv. rizikových skupin, což jsou mj. lidé nad 65 let nebo pacienti s chronickým onemocněním či s imunodeficitem. Těch v ČR se obvykle každoročně naočkuje okolo 600 tisíc. Tito pojištěnci mají očkování proti chřipce hrazeno z veřejného zdravotního pojištění. Další zájemci jsou v pozici samoplátců, nicméně často si mohou nechat úhradu plně či částečně proplatit z fondu prevence své pojišťovny.
Zdravotní pojišťovny také každoročně jednají s výrobci vakcín o ceně za jednu dávku. I letos se již podařilo s výrobci tradičních vakcín najít shodu na ceně za dávku tak, že jejich vakcíny budou mít rizikoví pacienti zcela bez doplatku.